Malwarebytes Anti-Malware ima mogućnost detektovanja i uklanjanja štetnog softvera, a ovaj alat prati svaki proces i zaustavlja štetne procese pre nego što oni budu pokrenuti. Najnovija verzija koja je objavljena nosi oznaku Malwarebytes Anti-Malware 2.0.3 i donosi veliki broj opcija, među kojima su mogućnost podešavanja prioriteta skeniranja sa ciljem unapređenja multi-taskinga, obezbeđena je podrška za JAWS i Windows Narrator Screenreader-a, a obezbeđene su i zakrpe za ranije primećene slabe tačke, među kojima je nekoliko onih koje su dovodile do krahiranja Malwarebytes Anti-Malware, a od ove verzije više ne dolazi do runtime grešaka tokom instalacije ili unapređenja.