Microsoft je upozorio korisnike Windows Home Server-a da ne edituju fajlove uskladištene na svojim backup sistemima sa nekoliko svojih programa ulključujući Vista Photo Gallery kao i Office-ovim One Note i Outlook, kao i fajlove generisane popularnim finansijskim softverima kao što su Quicken i QuickBooks. Kompanija u saopštenju navodi da kada koristite određene programe da editujete fajlove na računaru koji koristi Windows Home Server, ovi fajlovi mogu da postanu „pokvareni“ kada ih sačuvate na kućnom serveru. Kompanija preporučuje da dok se ne obezbedi update koji će rešiti problem korisnici ne korste ove programe na Windows Home Server računarima.